Universidad Tecnológica de Bolívar

Oferta académica


I Curso internacional; “Bioinformática y metagenómica aplicada al estudio de microbiomas”


Modalidad Tipo Público
Presencial 100% Curso Libre
Horario Duración

40 horas

Las diversas tecnologías de secuenciamiento de alto rendimiento y los últimos avances en el área de la bioinformática han revolucionado el estudio de ecosistemas microbianos dado que hoy en día es posible llevar a cabo estudios a una escala mayor con relación al número de microbiomas estudiados además de emplear técnicas moleculares con una sensibilidad mayor con relación a otras técnicas convencionales. A partir de este escenario la metagenómica ha surgido como el estudio del material genético, el cual ha sido obtenido directamente de muestras ambientales, o de comunidades de microorganismos asociados a un hospedero. Obtener un perfil de la comunidad microbiana en determinado ambiente es una de las tareas más importantes de los estudios metagenómicos. No obstante, el análisis funcional de estos microbiomas aporta una visión más dinámica de los diferentes procesos metabólicos relacionados a cada ambiente. De aquí la relevancia de comprender la metagenómica como área de investigación y técnica, pues en armonía permite llevar a cabo una caracterización taxonómica y funcional del ambiente muestreado. En este curso se ilustrará a los estudiantes en el manejo de bases de datos bioinformáticas públicas con el fin de manejar e interpretar datos metagenómicos, incluyendo enfoques basados en marcadores génicos, así como en la técnica “whole genome shotgun sequencing”. El análisis de datos basados en marcadores génicos se llevara a cabo por medio del uso del software R en el cual se utilizará para conducir análisis multivariados aplicando conceptos de ecología microbiana para explorar y comparar sets de datos.

Alcanzar competencias básicas aplicadas en los análisis de metagenomas dirigidas al estudio de microbiomas.

  1. Conocer los conceptos básicos y herramientas bioinformáticas disponibles para el análisis metagenómico.

  2. Adquirir habilidades para la formulación de proyectos de investigación en el área de metagenómica.

Nivel 1

Día 1

  1. Presentación del curso y estudiantes
  2. Introducción a la bioinformática
  3. Introducción a las ciencias “omicas” y meta (omicas)
  4. Bases de datos en bioinformática

Nivel 2

Día 2

  1. Continuación bases de datos en bioinformática
  2. Introducción a metagenómica y diseño de experimentos
  3. Técnicas de secuenciamiento para metagenómica
  4. Introducción al análisis de datos en metagenómica
  5. Sometimiento de secuencias y metadatos a ENA

Nivel 3

Día 3

  1. Bases de datos en metagenómica
  2. Introducción a estadística multivariada
  3. Ecología microbiana comparativa
  4. Metagenómica y sus aplicaciones

Nivel 4

Día 4

  1. Ecología microbiana comparativa
  2. Herramientas online para la visualización de matrices
  3. “omicas” aplicadas al estudio de la interacción patógeno-hospedero

  4. “omicas” aplicadas al estudio de ecosistemas marinos

Nivel 5

Día 5

  1. Metagenómica aplicada al estudio de la interacción parásito-vector
  2. Metagenómica aplicada al estudio de ecosistemas marinos
  3. Mesa de trabajo (Discusión acerca de los desafíos y fallas en metagenómica  -  Posibles proyectos a desarrollar en colaboración)

Metodología

El curso se desarrollará mediante clases teóricas y prácticas en la sala de computadores.

Dirigido a

Este curso está dirigido a investigadores y estudiantes que estén trabajando o planeen comenzar a trabajar en el área de diversidad microbiana y metagenómica.

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